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在拯救公主，尋找到真愛并且穩定住了Far far away王國后，并且有了“小史萊克”后，我們的史瑞克成了一個居家好男人。自然的，隨著時間的飛逝，史瑞克開始懷戀自己的本性“怪物”的一面。他又開始向往那些真正怪物過的生活。于是史瑞克被格林童話中的著名角色小精靈Rumpelstltskin所欺騙，與他簽訂了一份協議，使自己陷入了另外一個版本的Far far away王國的世界里。在那里Rumpelstltskin是國王，史萊克也得到了真正怪物的“對待”，被追殺，更重要的是，在這個世界里史瑞克和菲歐娜沒有相遇過。在認清事實后，史瑞克終于決定為挽回自己本應有的“真愛”而奮斗！
話說在很久很久之前（故事的開場發生在第一集《怪物史萊克》的前面）的遙遠王國里，一個叫Rumpelstiltskin（沃爾特·道恩配音）的精靈本來正得意的計劃著一件“好事兒”：他能夠解除菲歐拉公主（卡梅隆·迪亞茨配音）的怪物魔咒，而他想要換取的，則是整個遙遠王國的統治權。本來他已經成功的威逼利誘菲歐拉國王和王后交出統治權，可是，一個胖乎乎的綠頭怪卻解除了菲歐拉的魔咒，而且，還讓菲歐拉一直心甘情愿的做一名怪物！于是Rumpelstiltskin的計劃完全砸鍋，氣急敗壞的他決定再計劃一個名為“向史萊克復仇！”的陰帧�
若干時日過去了（現在，故事又發生在《怪物史萊克3》之后），史萊克（麥克·梅爾斯配音）開始了他平靜而無聊的生活，每天就是無所事事，還有和川流不息的游客們的合照……史萊克開始有些懷念起原來做怪物的日子了。正在這時候，他成功的解救了在馬車事故里“險些身亡”的Rumpelstiltskin，Rumpelstiltskin為了“報答”史萊克，遞給他一份契約，并且告訴他，只要簽下這份契約，就可以讓史萊克再做一天的怪物。開心的史萊克毫不猶豫的簽下了這份名為“一天換一天”的協議。結果，意想不到的事情發生了……
Rumpelstiltskin的魔法起效了，史萊克重新變成人見人恨的怪物，但是整個世界都被改變了：怪物們都被新的遙遠國王抓了起來，這位新國王就是Rumpelstiltskin，而驢子成了國王的馬車夫，姜餅人成了角斗士，穿靴子的貓胖得連跑幾步路都上氣不接下氣，菲歐拉公主更是根本不認識史萊克……Rumpelstiltskin告訴史萊克，這個世界已經徹底改變了，史萊克是不屬于這個世界的人，24小時一過，史萊克就會徹底從世界上消失掉。于是，為了拯救世界……當然，更重要的是拯救自己，史萊克踏上怪物斗精靈的險惡之路……
一只妖怪在打敗一條惡龍、救出一名美麗公主和拯救他岳父的王國之后，他還能做什么？如果你是史瑞克的話，你突然就會變成一個愛家好男人。他本來應該像以前一樣嚇跑村民，史瑞克現在卻心不甘情不愿地變成了一位名人，總是有人要跟他合照。妖怪嚇人的吼聲呢？他一直想要再享受一天真正妖怪的生活，于是不小心和小矮人蘭博簽下一紙合約，而史瑞克也隨即發現他已置身于一個不同時空、現實扭曲的很遠很遠王國，妖怪都被獵捕，小矮人蘭博當了國王，史瑞克和費歐娜則從來沒見過面。現在，史瑞克必須想辦法挽回他犯的錯，拯救他的朋友，讓一切恢復原狀，并且贏回他真命天女的芳心。
